這是首次就全縣受災情況進行估算。其中最多的是住房相關損失，達到2兆377億日圓，占一半以上。包括約8000棟完全損毀及部分損毀的住房在內，受損住房共計約17萬棟，此外不少住宅用地也受損嚴重，造成巨額損失。
在發布損失估算資料的同時，熊本縣還公布了8月制定的復原重建計畫修正案。其中提出要在今後大致4年內讓災民從臨時安置房遷入重建的自家住宅或災害公營住宅，並完成道路、供水設施等社會基礎設施修復。
工商業相關損失達8200億日圓。主要是工廠生產設備和旅館酒店等設施的直接損失，但遊客取消預訂等導致的損失未被計入。道路、橋梁等公共土木設施損失2685億日圓。
文物相關損失為936億日圓，被指定為國家歷史遺跡和重要文物的熊本城和阿蘇神社等損失嚴重。此外，農地及農用設施損失1487億日圓，廢棄物處理相關損失達到900億日圓。
內閣府5月就熊本地震公布的估算顯示，熊本縣損失額達1.8兆至3.8兆日圓。