莫蘭蒂颱風橫掃南台灣，全台農損超過6億元，高雄港也損失慘重，總統蔡英文和林全15日分赴屏東和高雄勘災，林全也在16日飛赴金門視察災情。林全表示，高雄港可說是在歷史上少有這麼嚴重的損害，但部分損失有保險賠償，政府最主要的工作還是希望維持高雄港運轉順暢。
而在金門的災情方面，林全指出，當地路樹受損嚴重，已經緊急調派機具和人力來處理。水電問題，也是搶修重點，將從台灣加派人力到金門協助解決。
農損部分，林全要求依照天然災害救助辦理，由地方政府認定後，相關的現金和低率貸款的救助，馬上就可來執行，至於房屋半毀和全毀的部分，依相關辦法規定，可以給他們幫助，台東上次風災後，有些房屋沒有半毀或全毀可以居住，但還是有損害，這部分在上次台東發生風災時有檢討，行政院訂了一個辦法，能夠提供適當的救助，這個救助辦法上次在台東實施，這次在金門也會照樣適用，不會有問題。碼頭部分，今天來看，希望可以儘快恢復，這部分要跟對岸確定雙邊都沒問題才能執行。