台北市政府去年5月20日以大巨蛋未按圖施工為由，勒令停工，遠雄公司今年6月6日以豪雨、颱風影響工地安全為由，向台北高等行政法院聲請停止執行停工處分。
台北高等行政法院7月21日裁定，大巨蛋停工導致水浮力、載重、鏽蝕與坍塌等問題，為維護安全跟防範危險，在應施作的範圍內，停工處分可停止執行。
外界解讀為大巨蛋可部分復工，再度引發爭議，北市府強調，是在維護大巨蛋安全範圍內遠雄可報備施工，遠雄需送審施工計畫書；但遠雄則認為依法院裁定可逕自入場施作，僅需將工項送都發局備查。
雙方數度隔空交火，北市府認為遠雄扭曲法院裁決，8月2日提出抗告，台北市長柯文哲甚至為此放話，表示遠雄若逕自復工，「我會出動警察」。
都發局長林洲民下午召開記者會，表示今天下午與遠雄開會，達成兩個共識，第一是遠雄同意施工項目「不是備查，是送審」；第二是遠雄要送施工計劃書，經都發局確認後，才可進場施作。
林洲民說，遠雄8月5日來函申請28項施工項目，今天下午經各建築、土木等各公會代表及專家討論後，同意遠雄有條件施作19項。其中17項都發局同意施作，包括全區檢修、防火、防洪、抽排水系統等相關工程。
另有2項是有條件施作，第一是巨蛋棟屋頂鈦板工程僅同意施作3樓以上，因為市府日前提出的減量方案，大巨蛋1樓跟2樓外圍需改為半開放空間；第二是全區地下室完整結構工程不含樓梯，因當初勒令停工的原因就是樓梯數目與建照圖不符，目前樓梯數量還在審查中。
另外，都發局認為建築物外牆跟載重或鏽蝕等問題無關，商場棟、影城棟、旅館和辦公大樓的帷幕牆及屋頂結構相關工程，以及大巨蛋的帷幕牆、PC看台版結構工程、球場地坪二次結構皆遭否決。
林洲民說，遠雄若認為這9項仍有施工必要，需再提出證據證明與法院裁定的「水浮力、載重、鏽蝕與坍塌」問題有關，都發局召集相關專家審查確認後才可施工。
林洲民表示，有條件同意的19項工項，遠雄不需完成全部的施工計畫書才送審，可分項、分階段送審，呼籲遠雄盡快完成計劃書、盡快送審、盡快進行。