翔利昇號漁船迄今仍扣案在海巡興達港基地進行調查，由於船體破損進水，辦案人員會同海巡定期對船體抽水。由於颱風尼伯特逼近，辦案人員擔心外圍環流帶來的風雨及風浪會讓破損漁船進水更加嚴重，將請示檢方是否將漁船吊上岸。
海軍金江艦1日誤射飛彈誤擊翔利昇號，造成船長黃文忠枉死，黃文忠遺體當天下午隨船返回興達港，漁船隨即被檢察官扣案調查，黃文忠家屬近日要求登船也被檢方禁止。
另外，對於家屬提出「漁船賠償，希望儘快賠償我們一艘新船，讓我們恢復正常生活，不希望依賴政府」的訴求，高雄市政府也允諾全力協助。地方漁業人士指出，翔利昇號級的漁船造價大約上千萬元。