政院官員指出，行政院長林全今天一整天都在立法院院會備詢，上午9時多就接到相關單位報告飛彈誤射事件，國防部長馮世寬也親自打電話向林全說明，林全在第一時間即掌握情勢，國安會也召開各種因應會議，有任何訊息就立即傳給林全及相關重要幕僚。
政院官員指出，誤射飛彈事件很早就已確定，但誤射造成的影響、船難與誤射事件是否有關當時仍不確定，林全中午便指示副院長林錫耀先南下高雄處理，林錫耀抵達後，下午2時多回報漁船事件與飛彈事件有關，但這需要有國防部的正式說法，國防部也於3時半舉行記者會。國防部舉行記者會前，有特別請部長辦公室主任熊厚基到立院向林全報告事發經過與記者會準備說明的內容，林全也詢問飛彈事件與漁船的關係、後續處置方式等。