南投縣無垃圾焚化爐，垃圾外運其他縣市焚燒，但需配合落地檢查，若被查獲垃圾混著資源回收物超過20個以上，就會被退運，必須再運回各鄉鎮市垃圾場分類，不但降低外運處理量，行政院環境保護署也會減少對南投的垃圾轉運補助款，呼籲縣民確實做好垃圾分類。
南投縣政府環境保護局表示，為協助清潔隊員收垃圾時辨識分類物，建議民眾不要用黑色垃圾袋，改用透明塑膠袋，方便清潔隊員辨識內容物，減少資源物誤丟入垃圾車，隊員若見黑色垃圾袋，加強破袋檢查。
縣府環保局表示，配合環保署垃圾減量政策，南投每天必須減量20公噸，民眾可在家中設置垃圾桶、廚餘桶、資源回收桶，隨手做好一般垃圾、廚餘、資源回收物處理，共同為南投垃圾減量努力，減輕處理負荷。
環保局表示，根據統計，縣內家庭產生的廚餘量，約占家庭垃圾量30%到35%，顯示許多廚餘未確實回收，提醒民眾凡是豬可吃的食物，如剩飯、剩菜、無骨無殼的食物，都可投入垃圾車懸掛的廚餘桶，塑膠袋、衛生紙、竹筷、牙籤、咖啡包、茶包都不行。