為了提升國家資通安全防護能力及推動資安科技發展，行政院在2014年5月，指定科技部為資通安全主管機關及國家資通安全科技中心的監督機關，以形成「行政院」、「科技部」、「國家資通安全科技中心」的資安三級制，「國家資通安全科技中心設置條例」也在去年底完成三讀，規劃在今年4月掛牌上路。
但「資安中心」的設立引發在野黨立委質疑，時代力量黨團更提出廢止案，經一個月協商期後，立法院院會3日排案處理相關議案。由於協商沒有共識，原本預料會上演表決，但國民黨團僅發言表達立場後就退席，因此全案順利通過廢止。
時代力量黨團總召徐永明表示，他們主張廢止，不代表就不關心資通安全，而是這項條例內容不夠周全。徐永明說：『(原音)而是認為主管我國資安業務上位法，資通安全管理法未通過前，貿然將負責我國資安業務組織，從原先二級管理降級為三級管理，有危害我國資安之虞。』
民進黨立委管碧玲也說，資安中心的工作內容及定位，包含有屬於公權力範疇的資安政策、資安防護，對於只是公法人角色的資安中心來說，並不利台灣資安環境發展。管碧玲說：『(原音)把政府對資安防護、產業發展以及產品認證全融為一體，組織就產生重大困難，也就是產業主導政策，國家資安政策完全在董事會由民間超過二分之一在主導，國家安全付之闕如，政府功能跟公法人功能混淆不清。』
國民黨團書記長林德福則認為，廢止資安中心後並沒有替代方案，這無疑是流失科技人才，他認為民進黨完全執政就要完全負責。