總統府發言人陳以信表示，翁啟惠上午8時入府向馬總統報告，會議時間約1小時。會中翁啟惠向馬總統以一份信函說明立場，經徵得翁啟惠同意，總統府將此信內容公佈。
陳以信指出，翁啟惠並未在會中向馬總統請辭，僅表示願意配合提前辦理交接。但馬總統強調，此事茲事體大，涉及最高學術機構中研院的聲譽，翁啟惠的決定恐與外界期待有所落差，希望翁啟惠能再慎重考慮。
翁啟惠在信函中向馬總統保證，「我絕對沒有內線交易、操弄股價，女兒購買浩鼎股票的資金也來自父母，更無賤賣中央研究院技術或貪瀆情事」。
翁啟惠信中也表示，此時辭職，不但造成人事大動盪，也引起國際關切，甚而影響我國際聲譽。「因此，如蒙
鈞座允准，職擬自即日起授權副院長處理自即重要行政，並檢討既有倫理規範及所有與職有利害衝突之事項」。
翁啟惠信中說，如新院長能及早確認，願配合提前辦理交接。在此期間，「職也會全力配合調查、釐清真相，並爭取職個人之清白」。1050425