台北港區段徵收工程的填土來自於紅火蟻疫情嚴重的桃園市，使得商港三路旁的公園和十三行博物館附近全部淪陷，博物館旁的草坪更於上周出現大量紅火蟻蟻丘，館方表示，3月起將有全面偵查及防治計畫，並將偵查結果，通知農業局及國家紅火蟻防治中心進行防治。
館方表示，日前於陽光廣場上發現3處紅火蟻丘，已立即通報農業局，並於蟻丘範圍進行藥劑灌注，並設立安全警示帶、警告標誌、公告及小型解說牌，來訪民眾可留意廣場上解說牌，以防遭紅火蟻咬傷，此外，為因應假日眾多遊客，館方將加強口頭宣導及加派人員巡邏，禁止民眾進入防治區。