教育部五年千億「新世紀高教藍圖計畫」引發新舊政權論戰，最後因民進黨反對暫緩；行政院發言人孫立群重話批民進黨搞不清楚狀況、不尊重；今（25）天民進黨總統當選人蔡英文則指出，未來大學要與在地產業結合，研發資源不允許無效率浪費，因此要暫緩高教藍圖計畫，將財源資源重做統合整理；教育部的任務，是為培育產業人才，教育系統也將重新調整和改造。
教育部祭出「新世代高教藍圖計畫」，從明年到2021年，預計再投入150億至200億在高教，引發教團反彈。對此，蔡英文昨批評，新舊政府過渡期間，不應核定跨年度的新計劃，教育部此舉相當不尊重。經民進黨多名立委與教育部長吳思華溝通後，吳思華也承諾，在未與新教育委員會達成共識前，不會將計畫送至行政院審核。
暫緩高教藍圖計畫，卻讓行政院發言人孫立群跳腳，批民進黨搞不清楚狀況。民進黨則回應孫立群才是對實際狀況不清楚，並表示這項計畫攸關國家重大資源使用，也牽涉未來政府施政方則，本來就該經過討論再決策，而非卸任官員自行核定、研議在三月間公告。
蔡英文今赴台中與產官學代表座談時，論及人才培育問題，也提及為何該暫緩該計畫。她指出，未來大學一定要與在地產業結合，研發資源不允許無效率浪費，因此要暫緩高教藍圖計畫，將財源資源重做統合整理；教育部的任務，是為培育產業人才，教育系統也重新調整和改造。