針對有民進黨立委提案廢除國父遺像，另訂鄭南榕紀念日等主張，遭國民黨文傳會主委林奕華批評是將「改革元年」變成「文革元年」，假借「轉型正義」之名，做的卻是數典忘祖的獨裁與鬥爭。
對此，民進黨主席暨總統當選人蔡英文23日在參訪生技業時受訪表示，台灣的歷史發展上有一些大家都認為應該面對的事情，而在大選期間，她也提出政策，希望面對這些歷史真相和轉型正義的問題，將來建立一套機制來全面處理。蔡英文說：『(原音)轉型正義的主要目的，就是在於釐清歷史的真相，能夠讓大家有討論的機會，讓社會不會在過去的歷史事件裡分裂，能夠因為我們處理轉型正義的事情後，國家可以團結的往前走。我們將來會設立機制，在民意基礎之上，全面處理轉型正義的問題。』
至於哪些事情要納入轉型正義討論，蔡英文說，待機制建立以後，按照機制進行。
另外，媒體詢問「黨產條例」在立法院受國民黨阻擋的看法，蔡英文說，社會上絕大多數的意見都覺得「黨產」是應該處理的事情；但如何合理的處理才是真正的挑戰。為此，她希望大家能夠平心靜氣的談一談，不要造成過度的政治對立。