今天是農曆大年初二，總統馬英九上午循例到苗栗縣通霄鎮馬家庄祭祖，接著到新埔義民廟向義民爺參拜，祈求保佑台灣風調雨順、國泰民安，今年能夠無災無難。
總統參拜完後致詞表示，此次前來義民廟參拜，除了祈求義民爺能幫助大家解決當前困難，讓每個家庭都能安居樂業，也希望大家一起為仍在瓦礫堆中等待救援的民眾集氣、祈福，「不管你來自於哪個縣市，今天我們都是台南人」。
總統表示，看到2月6日小年當天在台南發生震度5級的地震，造成很大傷亡，內心震驚、不捨與沉痛；災害發生後，他親自前往台南2次，安慰在醫院的傷患，心裡感到相當難過。
總統說，當大家都在歡樂過年時，在台南卻有那麼多鄉親無法過年、團員，尤其今早看到媒體報導有一對罹難的小姊妹，被搜救人員發現時2人緊緊抱在一起，他哽咽說「我也有2個女兒，看到後特別傷感」。
總統指出，直至目前軍、警、消等援救團隊已經救出200多人，其中超過40人不幸往生，更有超過100人現在仍在瓦礫堆裡等待救援，希望各地民眾能一同集氣，為他們祈福。
總統也說，今天已經是震災發生後的72小時，雖已過了「黃金救援時間」，但他認為僅供參考，並舉例17年前「921大地震」台北一處大樓倒塌，造成百餘人不幸往生，卻在災後第120小時，成功救出孫氏兄弟，強調「絕對不能放棄」。
「在卸任不到4個月前發生此災害，內心相當沉痛」總統說，到目前為止還無法用科學做精確預測地震發生，但其帶來的災害是可以預防的，房子蓋牢一些、橋樑堅固一點，就可以減少災害發生。
此外，往年都由總統親自贈送民眾福袋的行程，今年也因震災取消，改由廟方代為發送。