根據農委會統計，其中漁產損失估計損失金額30億1260萬元，受害最嚴重，主要是虱目魚、石斑、文蛤、吳郭魚、鱸魚及金目鱸等受損所致。
農委會指出，農產估計損失金額5億2747萬元，農作物被害面積9331公頃，損害程度19%，換算無收穫面積1734公頃；受損作物主要為巨峰葡萄，被害面積676公頃，損失金額8989萬元，其次分別為蓮霧、其他特作、食用番茄及草莓損失金額較多。
另外，畜產損失估計損失金額64萬元，主要是豬、蛋雞、土雞及小鴕鳥受損所致；民間設施損失中，農業設施被害面積24公頃，損害程度55%，損失金額380萬元，主要為農業設施結構毀損。
若以縣市別來看，農委會表示，台南市損失17億6574萬元最多，占50%；高雄市損失8億6812萬元、嘉義縣損失3億7093萬元、屏東縣損失1億214萬元、雲林縣損失9525萬元、彰化縣損失9315萬元。