根據《壹周刊》今（13）日報導，總統馬英九在選後，擬重返國民黨接任主席，並已經透過鴻海董事長郭台銘跟立法院長王金平接觸，希望獲得王派人馬力挺。對此，台北市長柯文哲表示，「國民黨的家務事，我們一向抱著看連續劇的心情一路看下去」，柯還笑說，這實在是跟民視晚上的連續劇一樣精彩。
媒體問到，國民黨立委蔡正元與新黨不分區立委提名人邱毅，近日頻對民進黨開砲，網友戲稱兩人是「正毅兄弟」，不過兩人為藍營選情加分似乎有限，對此，柯文哲表示，對他來說，他有新的心態，都把蔡正元當作「感恩、感恩、感恩」，媒體追問，民進黨總統候選人蔡英文是否也應對蔡正元感恩？柯笑說，「對啊！應該要有這樣的心態」。
至於他昨接受廣播主持人鄭弘儀訪問時，提到總統不能迴避九二共識問題，柯文哲表示，他也希望新政府要處理好兩岸關係，因為面對大陸還是要給它適度、應有的尊重，不能像他當市長一樣隨便講講，而且不用去面對這個問題。
柯文哲強調，以他的立場，對於九二共識是表示尊重，但到底新任總統只講「尊重」，能不能過關？他不曉得。