針對104年11月28日NGO團體遊行訴求有關憂空污惡化，籲中科停擴廠，對此，中科管理局特發布五點聲明回應，其中有關日前空氣品質不良事件，環保署已澄清係因特殊氣象條件，不是中科擴建或單一排放源所致；台中園區擴建案已落實防制及減量措施，削減量已遠大於排放量，中部科學園區是推動節能及綠能最積極的場域。
有關健康風險評估部分，中科管理局回應NGO團體遊行訴求有關憂空污惡化的聲明提出五點說明：
1.台中園區擴建計畫已依環保署訂定之健康風險評估技術規範完成健康風險評估，評估結果總致癌風險為「小於百萬分之一」符合標準，並經環保署環評審查通過在案，所稱「健康風險評估調查未完成前，中科擴廠立即停工」，係屬誤導。
2.有關台中市政府未來將執行之健康風險調查係屬市府權責，與台中園區擴建計畫並無關連。
3.依據「衛生福利部國民健康署之癌症登記線上互動查詢系統」，2013年台中市西屯區癌症死亡率低於臺中市，也低於台灣地區平均值。且經流行病學分析結果顯示，不管以臺中市或台灣地區為參考族群，各項癌症發生與死亡率皆未有穩定顯著偏高或偏低於參考族群之現象。
4.中科已於西屯區永安國小設置光化監測站，已累積多年之監測數據，依據專家分析結果，該地區污染源主要為車輛排放，並非源自中科園區。
5.綜上，依據流行病學調查資料、光化站實際監測數據及台中園區擴建計畫健康風險評估結果顯示，中科增加健康風險影響非常低，不會有無法接受之風險增量。
中科管理局說明，環保署已澄清日前空品不良事件，係因特殊氣象條件，不是中科擴建或單一排放源所致，因應措施則應全面。環保署11/14發佈新聞稿摘要指出，連日來臺灣附近吹東風且風速微弱，被中央山脈阻擋，導致西半部污染物擴散不良。在94年11月1日至5日也有類似的天氣型態；主管機關後續因應作為包括：電網調控機制化，依程度分級應變，研擬擴及移動源及其他面向管制。應用決策支援系統，以科學工具迅速提供管制策略。
中科管理局進一步說明，台中園區擴建案已落實防制及減量措施，削減量已遠大於排放量；工區已採高標準防制措施，主管機關（環保署、環保局、水保局）均有不定期至現場稽查，由地方代表及專家學者組成的環保監督小組也持續監督。至於在配合減量措施方面，包括施工階段，截至今年11月中旬，已洗掃街道達1,800公里，預定今年度可執行2,400公里。另外在減少稻草焚燒之友善措施部分，一期稻作於烏日區完成40公頃推廣稻草益菌肥之施行作業，並獲農民正面迴響，二期稻作已完成510公頃登記試作；營運階段將持續執行洗掃街（8,100公里/年）及推廣稻草益菌肥，減少露天燃燒（1,000公頃/年），估計每年削減細懸浮微粒15公噸，削減量遠大於擴建可能排放之4公噸。
中科管理局指出，科學園區是推動節能及綠能最積極的場域，其中中科園區高科技業認購綠電最多，例如：台積電公司認購1億度綠電，其效益可減少碳排放量5,200萬公斤，相當於2.1萬輛汽車1年的碳排放量與520萬棵樹1年的碳吸收量。目前最大屋頂太陽能發電廠（森勁公司）在中科台中園區，並持續推廣中。節能及綠能的具體實現有賴科學園區研發製造高效能的太陽能板、電池材料、高效節能晶片等。
有關「曲解中國醫藥大學2006年“中部科學園區周邊居民空氣之揮發性有機物暴露及健康風險評估”研究結果」的說明，中科管理局表示，依據最高行政法院（104年裁字第1612號）於104年10月8日駁回環團聲請台中園區擴建用地之停止執行案，法院裁定書明白揭示環團所提論文「…以其研究範圍及研究方法均非以本件開發計畫為標的，其研究建議尚難逕予援用…」。當時國內尚未訂定健康風險評估技術規範，該研究方法及結果被曲解，誤導民眾認知。作者結論已敘明該區域係受移動源（車輛排放）影響。並且中科已於西屯區永安國小設置光化監測站，已累積多年監測數據，依專家分析結果，亦顯示該地區污染源主要為移動源(車輛排放)，不是源自中科園區。分析光化站99-104年移動源特徵污染物測值有逐年下降趨勢，部分物種濃度低於環保署光化站測值(土城站-台北、忠明站-台中、台南站-台南、小港站-高雄)。