指揮中心上午表示，16日台南市新增183例本土登革熱病例，較上週同日減少16例，過去一週平均確診病例數持續下降；高雄市新增173例，再創單日新增新高，且較上週同日增加39例，過去一週平均確診病例維持上升趨勢，總計全國昨日共新增367例本土登革熱病例。
台南市疫情趨緩，高雄市則進入往年疫情高峰期，指揮中心表示，為保全戰果及防堵疫情擴散，台南市持續進行各項防疫工作，高雄市也加強防疫力道。
莊人祥表示，高雄市過去3週疫情持平，但這週維持上升趨勢，研判可能跟噴槍機具不足有關。從上週開始已經增加機具，20日也會有85具噴霧機到位，應該可以彌補不足之處，預期10月底前疫情可以反轉。
這波疫情自入夏以來，全國本土病例已達2萬4874例，其中台南市占2萬172例、高雄市占4274例、屏東縣占100例，其餘縣市均為移入的散發疫情。
16日新增4例疑似登革熱死亡個案，目前累計死亡人數為106人， 36例疑似死亡病例待審（台南30例、高雄6例），全國仍有44人於加護病房治療中。這波疫情已有2萬2500名確診病患康復，康復率達90.4%。
入秋轉涼，指揮中心提醒，登革熱症狀與感冒類似，請民眾勿掉以輕心，如為公費流感疫苗實施對象，特別是老人及有慢性病史者，儘早完成接種，以免誤以為感染流感而延誤診斷及就醫時機。