全台本土登革熱疫情自5月入夏至今已有9566例，日前行政院在「登革熱流行疫情處理協調會報」時表示，估計這波全國本土病例最高可能到達3萬至3萬7000例，估計疫情在10月底達高峰。
行政院今天表示，若全台疫情破萬或高雄市病例數破千就成立「中央流行疫情指揮中心」。
前衛生署疾病管制局長蘇益仁表示，中央疫情中心成立時機晚了一點，不過有成立總比沒有成立好，從目前情況分析，若疫情能控制在3萬例以下的病例就算成功，拉高層級就能跨部會溝通。
蘇益仁認為，疫情升溫，地方缺防疫專業人才，執行沒有科學依據，如噴藥前後的病媒蚊密度監測、成效評估及是否出現抗藥性問題等，都欠科學基礎。
「藥不是拿著就噴就有效」蘇益仁說，中央流行疫情指揮中心的成立，地方政府的防疫作為仍在土法煉鋼，讓病例數不斷上升，主要是因無科學防疫概念，相信由中央接管後，才能落實科學防疫，壓制登革熱。
高雄市流行第1型登革熱，而台南是第2型登革熱，因此防疫目標不同。蘇益仁表示，高雄市的疫情可能還是去年的延續，應徹底清除孳生源，而台南市疫情就是要全力防堵，避免擴散及過冬。
目前正值登革熱流行高峰，疾管署提醒，民眾如經確診感染登革熱，請遵照醫師指示服藥、多補充水分，儘量在家休息；發病後5日內，應避免被蚊蟲叮咬，以減少病毒藉由蚊蟲散播，並做好防蚊措施，包括：家中裝設紗窗紗門、穿著淺色長袖衣褲、睡覺時掛蚊帳、使用捕蚊燈或電蚊拍（蚊香僅具驅蚊效果）、必要時塗抹防蚊藥劑。