反菸團體董氏基金會12日才舉發高雄市政府從2008年起，每年都以「私劣菸酒查緝」的名義，自「查緝私劣菸品」績效獎金中，編列新台幣200萬元，組團到全球三大菸廠之一的日本菸商「傑太日菸」全球工廠參訪，違反國際菸草控制框架公約「不與菸商建立任何夥伴關係」的準則。14日董氏基金會又前往行政院陳情，要求政府禁止「傑太日菸」在台南科技工業區設廠，但沒有結果。
董氏基金會17日則前往監察院，控告經濟部及衛生福利部違法核准日本菸商在台設廠，不僅毒害人民健康，也違反國際菸草控制框架公約「政府不應提供優惠待遇予菸草業」的指導原則，並違背我政府「外國人投資條例」規定，禁止外國人投資對國民健康有不利影響之事業。
對此，衛福部發言人王哲超表示，這是政府跨部會審議的結果，並不影響衛福部推動菸害防制的立場，也希望未來投審會能將菸害防制的精神及規定納入考量。他說：『(原音)我們衛福部全力推動菸害防制相關措施的立場絕對沒有改變。有關菸廠設廠呢，這是一個經濟投資的個案，那它有一個跨部會的審議機制，目前我們衛福部尊重這樣的一個結果。當然我們希望未來有相關的投資審查會議，能夠多加注意世界菸害防制公約以及我國的菸害防制法相關的規定跟精神。』
由於傑太日菸在台灣的總投資金額高達新台幣92億元，被政府列為重大投資案，目前廠區已在興建中，預定明年2月即將營運。