法官開庭時，檢方說明陳福祥犯行如何殺害蔡宗育及蔡鎧陽過程，蔡宗育的母親當庭落淚不止，蔡鎧陽的母親則神情凝重。
陳福祥在庭上坦承槍殺兩命，法官訊問殺害蔡宗育的動機？陳福祥說，「蔡宗育是第一個（死亡）？還是第二個（死亡）？」、「原本一開始沒打算殺他們兩個」。
陳福祥說，因懷疑蔡宗育掏槍所以槍殺，後來去買飲料回來的蔡鎧陽走回停車格時，他跟蔡鎧陽說「已經一條人命，不要亂動，我走就好」，但蔡鎧陽走進車裡拿東西，他本能反應就開槍了。
陳福祥說，他拿走的購毒款新台幣440萬元是不該拿的錢。檢警扣到的巴西制式手槍、衝鋒槍及165顆子彈。他指出，槍是他的，10幾年前就一直藏在家裡屋頂，其中164顆制式子彈也是他的，剩下一顆是他卸下死者車上找到的槍的彈匣時掉出來的，而死者車上的槍，他順手丟在忠孝橋上。
陳福祥說，他拿走440萬元後，再加上他身上及家裡的錢約有700萬元，其中拿了220萬給友人，警方逮到他時，身上只剩40萬元。
台北地檢署5月間偵結西門町峨眉停車場雙屍案，認定殺手陳福祥槍殺前來取毒的兩人，漠視人命且惡性重大，依殺人罪起訴，並建請法院判處極重之刑；至於幫助藏匿陳福祥的洪廣明等6人，遭檢方依藏匿人犯等罪起訴。