營業用房屋法定稅率為3%至5%，目前各縣市多採最低稅率3%，低於非自住房屋稅最高上限稅率3.6%。財政部說，若適度拉高營業用房屋徵收率，重稅不利自住型個人租戶的疑慮即可獲得解決。
囤房稅去年修法後，全台擁有多戶房屋的房東，非用於自行居住的房屋，持有稅負已全面上升，今年5月房屋稅開徵時，即會顯現增稅效應。
新法施行後，部分縣市為強化抑制囤房的效應，將擁有三棟以上非自住房屋者，適用的房屋稅徵收率訂為3.6%，其中以台北市為代表。財政部表示，台北市營業用房屋稅率目前為3%，已較住家用房屋中的「非自住」（即出租供他人做為住家）房屋，低了0.6個百分點。不過台北市政府已表態不會調高營業用房屋稅率。
以房屋課稅現值（已包括標準單價、地段率、面積等）200萬元的房屋為例，所有權人名下若擁有三棟以上房屋，其中一戶位於台北市，且出租給他人時，出租給營利事業做營業使用，房屋稅約為6萬元；但若租給他人做住家用，房屋稅負會增為7.2萬元。
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