法務部推薦司法官學院長林輝煌出任大法官，由於林輝煌是美麗島案件軍事檢察官，引發綠營、人權團體抨擊，美麗島事件辯護律師、前行政院長蘇貞昌13日表示，若不顧輿論反彈，執意如此，不但是對台灣民主的重大傷害，也是對轉型正義最大的諷刺，更充分突顯執政者對這塊土地的歷史及人民的無知與傲慢。
法務部長羅瑩雪日前指出，提名法務部政務次長吳陳鐶、林輝煌出任大法官，吳陳鐶是第一順位。當時沒特別了解林輝煌這層背景，林輝煌在司法官學院表現良好，是優秀人選，沒有人是零缺點。
美麗島事件受刑人、高雄市長陳菊表示，林輝煌在美麗島事件軍法審判受刑人、打壓台灣民主發展；如果提名林輝煌，台灣的轉型正義宕然無存，台灣社會無法接受。
前行政院長謝長廷質疑說，擔任美麗島辯護律師是他從政生涯的起點，當年他主張不為被告個人辯護，而是為事件辯護，如今歷史也還給美麗島案被告的清白，但是以「轉型正義」的角度來看，當年以叛亂罪起訴被告的林輝煌，為何可以擔任大法官？
謝長廷認為，林輝煌要誠實說明當年在加害體制的這段歷史，對台灣的「轉型正義」才有正面意義。