根據平面媒體報導，台北市長柯文哲為了討回北市府替捷運新莊蘆洲線代墊的百億元，已在去年底委託律師向交通部提告、要求還錢，而且就連新北市長朱立倫也告。對此，柯文哲今（6）日表示，事實上不是要告新北市政府，「新北市政府正確的講法叫做關係人」，主要目標是交通部，地方政府和中央政府有爭議，應該要去處理，會儘速跟交通部再來協商。
柯文哲下午參觀龍山寺聯開宅，接受媒體訪問時，作上述表示。
柯文哲說，新政府到現在成立兩個多月，有時候再整理過去舊的帳，這是一個議題是說，以前在蓋捷運新莊蘆洲線，新北市政府要付，省政府要付，台北市政府要付，因為統籌機構是台北市政府，所以北市府是先付代墊，後來精省以後，省政府要付的就找不到案主了，錢要怎麼在帳目上解決，應該要去處理。
柯文哲表示，今天只是提出一個問題是，要怎麼解決，其實是處理過去的帳，交通部說他們要解釋也可以，事實上不是要告新北市政府，「新北市政府正確的講法叫做關係人」，主要目標是交通部，地方政府和中央政府有爭議，應該要去處理，雖然有法律程序在進行，市府會儘速跟交通部再來協商，看這筆錢在帳面上怎麼解決。
媒體問到，為何不先協商？柯文哲說，因為台北市議會有決議一定要處理，加上審計部糾正，其實這個問題不是今天才有，是好多年前的帳，「只是我們做為比較勤勞的政府，不會擺著不理它」，既然有爭議就趕快處理。