孫立群傍晚透過新聞稿表示，由於天候不佳，搜救人員非常辛苦，中央災害應變中心除協調復興航空提供暖爐，並請國防部提供熱水外，毛治國今天並致電國防部長高廣圻，調度乾式潛水衣20套，提供深水區人員優先使用。
他強調，現場工作所需器材，中央都盡全力調度。
媒體指中央未投入救災；孫立群表示，毛治國已於空難當天中午1時20分坐鎮民航局「空難中央災害應變中心」指揮，引導跨部會合作；行政院副院長張善政也於當天中午12時15分第一時間先行前往應變中心，指揮調度。
孫立群指出，依據災害防救法第12與13條規定，當災害達一定規模時，各級政府除第一時間投入救災外，中央及地方政府都應成立應變中心，統籌各項資源積極搶救災害。
他說，毛治國在這次空難事件中，指派交通部長陳建宇為中央災害應變中心指揮官，統籌整體救災進度、整合航空業者與相關部會，並與地方災害應變中心指揮官、現場指揮官配合，構成良好救災機制。
孫立群表示，中央災害應變中心指揮官陳建宇具備調派國軍、空勤、消防署、海巡署，交通部所屬資源支援、以及指揮陸委會聯繫兩岸的權責。
他說，中央災害應變中心與台北市政府應變中心隨時保持密切聯繫，並每天以視訊會議同步連線，即時瞭解地方救災情形，掌握最新資訊，提供救災支援。
行政院資料指出，截至今天為止，中央投入搜救動員能量共計1574人次、250輛車輛、106艘船艇、75具潛水設備、27架次直升機及5部金屬探測器。
中央災害應變中心並指揮交通部調度700噸及400噸大型吊掛機具、國防部出動照明設備、M3浮橋車、沐浴車及提供乾式防寒衣。
法務部檢察署24小時輪值確認罹難者身分，40名死者死亡證明均已發放；移民署也緊急完成相關陸籍人士入台許可證150張，交通部民航局並設置網頁專區提供遺產繼承、稅務、法律常識、心理輔導等資訊，以利傷者及家屬運用。