復興航空一架由台北飛往金門的班機4日上午墜落在基隆河，救難人員迅速展開搜救作業，搜救工作持續到5日凌晨1時多，仍有12人尚未尋獲，部分機身殘骸也還在河底，打撈起的機頭與機尾已嚴重扭曲變形、支離破碎。凌晨2時，失事現場下起大雨，導致視線不良，加上寒流來襲、天氣相當寒冷，考量救難人員的安全，打撈作業暫告一段落，救難人員改以河面搜尋的方式漏夜搜救。
救難人員在5日清晨6點半再度展開水下搜救作業，共出動33艘潛艇、60名潛水人員及60名消防人員，在上午10時多從河下吊掛出飛機的發動機及部分機身殘骸，以及一具遺體，死亡人數已累積到32人，仍有11人尚未尋獲。
台北市消防局代理局長吳俊鴻表示，由於事故發生當時，水流相當湍急，部分乘客可能已漂流到下游，救難人員將擴大搜救範圍，往彩虹橋及大佳河濱公園的方向繼續搜索。他說：『(原音)我們會請將近50、60位的潛水人員到河堤做水下搜索作業，另外會派北市、新北市各10艘船艇，在整個基隆河的河域做全面的搜索，因為昨天發生的時候，水流非常的湍急，所以我們一樣，整個河域從下游到上游都會仔細詳細搜索。』
為了加速搜救作業，救難人員也出動魚探器、水中攝影、霸王勾等器具，協助水面下的搜索工作，希望能盡快尋獲11名失蹤者。