台灣疾管署2015年1月23日公布，一名2歲男童已經接種疫苗，但卻仍因感染流感併發重症致死的個案。從發病到死亡只有短短一周，病毒檢驗結果是H3N2，為台灣104年第二例。該男童曾在103年11月初接種流感疫苗，104年1月9日出現咳嗽、發燒等感冒症狀，共轉診就醫3次，13日有胸部凹陷、呼吸窘迫現象轉至醫學中心，並送到小兒加護病房治療，兩天後因多重器官衰竭病逝，流感檢驗結果為H3N2。疾管署2015年1月23日表示，此為繼之前90多歲男性，同樣也是因H3N2變異株致死的第二例。台灣疾管署副署長莊人祥說，104年的流感疫苗保護力雖包含H3N2，但是實驗室研究人員分析台灣社區流感病毒株發現，台灣H3N2病毒株已變異，和疫苗內的病毒株差異達到2成7，打了疫苗的民眾也要留心。莊人祥表示，目前北半球整體流感活動持續，各國多已進入流感高峰期，病毒主要流行型別均以H3N2型為主，依往年經驗，台灣流感疫情多自11月下旬升溫，於年底至翌年年初進入流行，一般在農曆春節前後達到高峰，3月後才脫離流行期。台灣104年1月1日至22日累計17例確定病例，2例死亡，93.8%的死亡病例有慢性病病史。北半球整體流感活動持續，各國多已進入流感高峰期，病毒主要流行型別均以H3N2型為主。疾管署提醒民眾，接種疫苗仍是預防流感最有效的方法，目前台灣公費流感疫苗剩餘量約10萬劑，符合公費條件的民眾儘速接種，以提升自我免疫力。此外，平時應落實勤洗手及注意呼吸道衛生，儘量避免出入人潮擁擠、空氣不流通的公共場所，以避免流感病毒侵襲；如出現發燒、咳嗽等類流感症狀，請戴上口罩儘速就醫，並在家休息。