提昇空氣品質，故為有效落實污染者付費原則，嘉義市政府環境保護局每年皆全面清查轄區應申報空污費公私場所，查驗並核對是否有漏報或申報錯誤之情形。固定污染源空氣污染防制費申報期間為每年1、4、7及10月，103年第4季空氣污染防制費己於104年1月1日開始申報，提醒轄區業者，請務必按時申報。
此外，嘉義市政府環境保護局為提升業者空污費申報方便性，輔導轄區業者，提出年申報申請作業。透過年申報辦理，減少業者申報次數，提升業者便利性。目前已申請年申報空氣污染防制費業者計29家。依據行政院環境保護署公布修正之空氣污染防制費收費辦法，其公私場所各季硫氧化物、氮氧化物及揮發性有機物，經中央主管機關核定排放量皆於1公噸以下，得於次年1月底前，報經中央主管機關同意，調整為每年1月底前，將前1年各季空氣污染防制費費額一次申報及繳納。
嘉義市政府環保局提醒應申報空氣污染防制費之公私場所，由於空污費103年第4季申報截止日104年1月31日適逢例假日，故順延至104年2月2日截止申報，請於申報期間上網登入帳號，並完成申報作業，避免因漏報而受罰。另行政院環境保護署為增加業者繳費之便利性，103年10月1日起新增四大超商(7-11、全家、萊爾富、OK超商)及郵局等電子化金融代收，倘若對於空污費申報流程或申報內容有疑義者，可致電空污費諮詢專線(05)2251775轉分機722，將有專人提供詳盡的說明及服務。