葉匡時進入公職前是中山大企管系教授，反應快、口才佳，也很有創意，到政府服務6年多，他當時的想法就是想為國家做事。
交通部的業務包山包海，葉匡時剛任交通部政務次長時充滿熱忱，他說，要進廚房就別怕熱。2年前接任交通部長後，創新並改變部務會報開會方式，例如帶同仁看畫展，或參觀民間公司的環保建築，新思維新作風，希望打破公務人員僵化思想。
高鐵財改案是在行政院長毛治國擔任交通部長時，就著手規劃的項目，葉匡時接手後，更視為他任內的重要工作之一。
不過，營運8年的高鐵，財務惡化始於當年得標時，財務規劃就不當，不但運量高估，35年的特許期造成折舊沉重負擔，加上興建期為籌資金發行的特別股為追討股本打官司，五大原始特別股股東不願增資，一連串複雜問題，讓交通部傷透腦筋。
但高鐵這幾年下來，已是台灣重要交通命脈，交通部無論如何都得確保營運不中斷，因此必須研究出一套聯立方程式，希望徹底解決高鐵財務沉痾。
葉匡時為了高鐵財改案，還特別從證期會邀請財務專家范志強坐鎮。
葉匡時原本對高鐵財改案信心滿滿，且不厭其煩多次到立法院報告，還私下與立委溝通，光是對外界講述高鐵財改急迫性及如何透過減資、增資與延長特許期完成財改，就對外說了10餘次。
不過，高鐵問題太複雜，立委質疑為何延長特許期40年，及延長特許後的利益計算，葉匡時即使多次解釋不延長特許期，就沒有增資誘因，並公布其他年限特許期的利益比較，40年最理想，仍屢遭朝野政壇質疑。
而部分立委指高鐵財改案圖利財團，讓葉匡時最難接受，讓他灰心的是，即使一再強調將由泛公股主導，仍難排除立委的疑慮 。
葉匡時先前已4次到立法院報告高鐵財改案，第3次還特別做了投影片，有如教授上課；儘管在立法院還是將已經解釋過的問題，再耐心說給立委聽。但當立委接連表達不同意高鐵財改案時，葉匡時愈來愈無力，並說出，如果立委原本就抱著不相信的想法，他說再多次也沒用。
葉匡時在立法院7日擋下高鐵財改案後，就宣布請辭交通部長，連老長官毛治國連日慰留都留不住，而高鐵面臨破產的僵局，成了下任交通部長的燙手山芋。