多數民眾並不會感覺高鐵有嚴重財務危機，交通部也保證，即使高鐵破產，也維持正常營運，高鐵財改案，因離民眾太遙遠，關心的部分只剩下高票價何時降。
不過，要降票價，還是要回到財改問題，因為擺在眼前的事實，股本台幣1053億元的高鐵公司，目前累積虧損470億元，高鐵興建期間發行的特別股已到期，高鐵公司無錢贖回，特別股股東只好打官司。
包括大陸工程、中華開發銀行、板信、聯電提告，在一審判決時都獲勝，大陸工程35億提告案正二審中，交通部律師團研判，最快明年3月三審定讞，交通部敗訴機會極高，預期引發所有特別股股東求償，392億元特別股股本及141億元股息，高鐵新債務立即增加533億元。
而高鐵公司目前股東權益只剩482億元，可以動支的現金只有18億元，當特別股求償股牌效應出現時，高鐵只有破產。
交通部支持的高鐵財改案，是希望經由減資，打掉虧損，同時同意與高鐵公司修改合約，將特許期由35年延長至75年，並與銀行團溝通，將讓高鐵公司計畫專戶內的現金解涷，部分做為贖回特別股的資金，部分做為高鐵增資需求。
高鐵計畫專戶原本是銀行團為確保債權，要求高鐵公司提撥一定比例營業額存在計畫專戶內，目前約436億元，銀行團同意，高鐵財改案若執行，就同意高鐵公司動用計畫專戶內的錢。
台灣高鐵10月下旬就公布財改案內容，原希望11月開始執行，原預定明年1月14日與與交通部修改合約，2月下旬召開臨股東會，立即進行減資、增資，希望4月完成第1階段私募增資。
不過，立法院交通委員會要求高鐵財改案一定要送交委會審查，11月至今，除了交通部報告外，還召開公聽會，但部分立委對特許其延長的年限仍有疑慮，擔心圖利財團，也有立委認為，就趁機會讓政府收回高鐵。
交通部長葉匡時一直設法希望高財改案，年底前能過關，因行政部門遲遲未能說服立法部門，立法院交委會將財改案審查再延到明年1月7日。
高速鐵路工程局分析，時間己相當緊迫，原計畫修約及臨時股東會時間，勢必延後，財改案明年能否過關，沒有人有把握，政府收買方案隨時準備啟動。
根據高鐵局對政府收買方案規畫，高鐵破產，就要與高鐵公司終止合約，政府立即承擔高鐵3083億元銀行債務，所有股東都血無歸，接著政府要強制接管營運，並進行資產鑑價，以帳面價值粗估收買金額，約3861億元。
最麻煩的是，政府還要另外找1家公司營運高鐵，招商時同樣會面臨特許年期長短、許利益分配及是否圖利特定對象的問題，但若高鐵走向破產，政府只有收買善後。