教育部規定國中教育會考免試入學超額比序，要先比完3等級、4標示之後，才能比10量尺。不過台北市、新北市及基隆市教育局會商後，決定明年北北基免試方案將直接跳過4標示，在比完3等級之後就比10量尺，並於11月7日對外公告實施。
不料，9合1選後，地方首長大洗牌，教育部長吳思華也於27日下午拜會台北市長柯文哲，希望新任市長能改變前任市長的決定，依照教育部的規定來執行。結果雙方對談半小時後不歡而散，柯文哲甚至對吳思華說，「我可以做4年，你部長能做多久？」
對此，新北市長朱立倫28日上午受訪時指出，北北基情況比較特殊，教育部不應一昧要求全國採取統一的模式招生。他說：『(原音)我們從頭到尾的立場都是一致的，因為北北基的情況比較特殊，教育部不可能用全國統一的一個方式，來做這樣的一個規定。否則的話，高分低就、低分高就的一個情況又會發生。那當然怎麼樣在這樣的一個基礎之上，大家能夠做一個更妥適的一個研擬，應該是這樣的立場，而不是教育部就一昧地要求，從過去郝市長到現在柯市長，或者是針對新北市、基隆市要求，就照教育部的立場，我覺得教育部這個態度要改變。』
不過教育部表示，依照相關規定，各就學區要使用量尺分數必須先申請，經過教育部核准後才能使用。因此，基北區可以通過直接比量尺的方案，但教育部也可以不核准基北區使用量尺。