總部設於馬來西亞的亞洲航空是透過獨資子公司亞航投資有限公司（AirAsia Investment Ltd），持有3家子公司，包括印尼亞航、泰國亞航與亞航資本有限公司（AirAsia Capital Ltd），其中持有印尼亞航49%股權。
印尼亞洲航空原先名為Air Wagon International，是瓦希德（Kiai Haji Abdurrahman Wahid）在1999年創立的廉價航空公司，持股權49%，但當年10月他當選印尼總統後，立即放棄航空公司股權。這家航空公司在2000年6月22日正式營運，不過，隨即在2002年3月停飛。
直到2004年12月，馬來西亞的亞洲航空總裁東尼．費南德斯（Tony Fernandes）看中這家公司的潛力，收購這家停止營運公司的49%股權，另外51%股權為印尼公司Fersindo Nusaperkasa，主要是印尼政府不允許外國公司持有航空業股權超過50%。
為了統一營運，2005年12月亞航將這家公司改組為印尼亞航，正式開啟了印尼亞航運作。同時，當時營運樞紐機場設在雅加達蘇卡諾．哈達國際機場，第二樞紐為峇里島伍拉．賴國際機場。
這家公司主要航線除了印尼境內外，還包括馬來西亞、新加坡、泰國、澳洲等。根據今年5月數據統計，目前共有30架A320-200型空中巴士客機，平均機齡為3.6年。
據瞭解，近年來台灣廉價航空業發展蓬勃，印尼亞洲航空也預定即將到來的農曆春節前後進入台灣市場，並先開航峇里島—台北航線試水溫。
根據亞洲航空今年5月12日發布的2013年年度報告書透露，目前亞洲航空是透過獨資子公司亞航投資有限公司（AirAsia Investment Ltd），持有3家子公司，包括印尼亞航、泰國亞航與亞航資本有限公司（AirAsia Capital Ltd），其中持有印尼亞航49%股權。
根據印尼亞航今年7月消息，印尼亞航看好今年搭客量可創下800萬人，高於去年的780萬人，因此放眼今年營業額目標為6兆印尼盾（約新台幣153億元），高於去年的5.8兆印尼盾。