柯文哲上任後，立即拆除忠孝西路公車專用道，也與教育部長激辯十二年國教議題。
李登輝今天參加台灣大學農業經濟學系「系友回娘家」活動，李登輝受訪指出，柯文哲選舉時就提到忠孝西路公車專用道問題，「我有去看，我覺得他講的很對」，柯文哲有講就去處理，這是應該的事，而處理後看起來似乎交通比較好。
李登輝也認為，教育人事問題應該讓地方政府決定，地方最了解，家長意見也很多，應該這樣做比較好。
對於媒體報導，教育部長吳思華強調他對此要負政治責任，柯文哲則說「你負什麼政治責任？」「我還有4年要幹，你隨時可以下台，負什麼政治責任？」。李登輝笑說，「這點我覺得他（柯文哲）有魄力」。
李登輝認為，市長如果長久沒換，換個新人，氣象就不同，要改的地方就該改。
他說，台北市還有很多事情要處理，像美河市的問題相當嚴重，慢慢來改。
李登輝也說，柯文哲施政像醫生，病人肚子痛要開刀，柯文哲就馬上開刀，這樣的性格，有好的地方，但也很危險，要小心一點，他就跟柯文哲說「要謙卑、冷靜、忍耐」，這很重要，事情這樣才能比較圓滿。
他表示，市長應做的就去做，但有些事太快講、做不好，也是可能發生，他相信柯文哲做1、2年後，就比較了解怎麼做。