基北區11月公布民國104年免試入學方案，在超額比序部分，直接跳過國中教育會考「標示」，在「等級」之後直接比「量尺」，教育部不予備查，爭議延宕至今。
柯文哲日前受訪表示，原則上維持原案，但北市家長對量尺分數的理解與教育部不同，上任後會盡快跟家長溝通、定案。
國教行動聯盟認為，台北市教育局已將量尺的算法告知家長、老師、校長，現階段不應再修改104學年度免試方案。並強調基北方案不是最好，但比教育部方案（先比標示再比量尺）更能彰顯「一分耕耘，一分收穫」的普世價值。
104學年度免試入學，全國15個就學區中，只剩基北區尚未定案，也只有基北區提出刪除「標示」的方案。其中最大爭議，在於等級、標示屬「標準參照」，量尺則是類似基測的「常模參照」，兩者的原理和用法不同，比序順次影響學生的升學權益。