台北市議會以往都是國民黨最大黨，國民黨在上屆擁有三十一席，民進黨則有二十三席，這次過半需三十二席，而國民黨只剩二十八席，民進黨成長到二十七席，無黨籍三席、親民黨兩席、新黨兩席以及台聯一席。
柯文哲說，他計畫每週一、三、五召開市長室會議，週三開市政會議，另外一天則召開府會平台會議，找黨團三長來開會，這是學習日本，要先找黨團協商，開會不只是簽名蓋章，而是要在各項市政推動前，做好事前的溝通，避免事後衝突。
今年九月底，柯文哲參訪日本東京都議會，交換在野大聯盟執政的看法。當時自民黨政調會長高木啟議員就說，每個黨團都有幹事長、政調會長、總務會長等「黨團三長」，施行政策前都會跟三長談過。因此，柯文哲的黨團三長概念從此得來，循此方式運作府會關係。