現行食安法規定，經中央主管機關公告類別與規模食品業者，應依產業模式，建立產品原材料、半成品與成品供應來源及流向追溯或追蹤系統。
三讀修正通過條文明定，中央主管機關為管理食安及品質，確保食品追溯或追蹤系統資料正確性，應依溯源必要性，分階段公告使用電子發票。
如果業者申報、登錄作業不實，開立電子發票不實以致影響追蹤追溯，三讀修正通過條文明定，可處新台幣3萬元以上300萬元以下罰鍰；未開立電子發票，經命限期改正，屆期不改正者，也處3萬元以上300萬元以下罰鍰。
院會通過附帶決議，要求衛生福利部食品藥物管理署民國104年10月底前分階段完成公告使用電子發票業者。