為有效改善嘉市空污問題，保障市民生活品質，嘉義市政府環境保護局加強進行柴油車排煙污染的改善，並設置空氣品質清淨區共同維護民眾健康。嘉義市政府環境保護局林建宏局長表示，經調查嘉義先期交通轉運中心，每日約有900多輛次柴油車輛進出，進出量相當高，為避免其空氣品質造成周遭與進出之民眾之危害，管制嘉義轉運站，並設為空氣品質清淨區為示範點。
這次轉運中心結合柴油車自主管理政策，林建宏局長表示，設立本市首處空氣品質清淨區，也獲得業者的全力配合，預期將可改善鄰近區域之空氣品質，讓市民們搭乘便利的交通運輸工具的同時，污染由環保局為您把關確認，以保障周遭居民與搭乘民眾的健康。
世界衛生組織（WHO）2012年已將柴油車排放的粒狀污染物，由疑似致癌物變更公告為確認致癌物質，其危害程度等同於吸二手菸影響人體的呼吸器官，危害人體健康。
嘉義市環保局自102年起即與進駐轉運中心之各家客運業者進行溝通協調，告知轉運站將禁止屬於1、2期高污染的老舊柴油大客車進入，其餘3期（含）以後之大客車，也必須完成排煙污染檢測並且取得全國一致標準之自主管理認證標章後始得進入，獲得各家業者一致贊同並配合執行，目前所有進駐車輛約222輛已全數納管並取得自主管理標章；同時也一併輔導火車站前的嘉義縣公車接駁站出入的83輛公車，均檢測合格並取得自主管理標章，以達管制減量之目的與提升前後站空氣品質。