根據事前送至立法院的書面報告，國安會104年度歲出編列新台幣2億478萬1000元，較上年度減少62萬4000元。
報告表示，國安會評估國家安全環境，主要威脅包括中共軍事威脅、非傳統安全威脅、東南海主權爭議、爭取國際空間、經貿自由化停滯等。
報告說，國安會104年度重點工作包括續辦理政軍兵推，提升國安應變能力；因應恐怖攻擊、組織犯罪、天然災害、網路攻擊、傳染疾病、重大環境污染、重大民生議題等非傳統安全威脅，增進整體國家安全；鞏固活路外交，拓展國際空間
報告指出，其他重點工作還包括加入區域經濟整合，拓展企業外貿市場；穩健推動兩岸關係，確保臺海和平穩定；建構完善人才策略，促進產業發展；因應網路安全威脅，強化整體資安防護機制。
報告也指出，依「國家安全會議組織法」規定，國家安全會議為總統決定國家安全有關之大政方針之諮詢機關，國家安全指國防、外交、兩岸關係及國家重大變故的相關事項。
因此，國家安全會議除預為研判可能的風險，提出先期防處建議外，並依情況的嚴重性、複雜性及廣泛性，採觀察、監控、介入、主導等4個階段，適時、適切協助行政部門應處，有效降低非傳統安全威脅的危害。