為落實政府積極處理食安問題的決心，馬總統晚間召開第二次國安高層會議，請行政院報告「強化食安八項措施」執行進度，以及行政院「食品安全辦公室」的籌辦情形；未來也將不定期針對食品安全問題召開國安高層會議，密切掌握行政部門的處理成效。
這次劣質豬油事件重創食品產業，預估受衝擊的產值達新台幣166.6億元，已是國安問題。
馬總統於13日第一次主持國安高層食安會議時，指示國安單位全力蒐報食安預警情資及發掘不法案源。國安局已於16日偕同警政署、調查局成立「預警會報」，於2週內先期蒐整食安問題檔案及檢舉資訊，主動提供行政院「食安辦」參考。
此預警會報也將納入海巡署、移民署及憲指部等機關成員，以利統合發揮國內、國境、境外及海域的黑心食品查緝能量。
此外，國安局也規劃編成專案情報及聯合應處中心的架構，負責食安預警情資的統整、建言、篩濾及成效管考，未來遇到重大食安案件，將立即將情資通報給權責機關。
馬總統並指示警政署規畫專案，全力清查國內食品相關地下工廠，在一個月內清查完畢。