孫立群表示，為統籌規劃食品安全政策，協調中央及地方權責機關預防及處理重大食品安全事件，推動食品雲的建置，以保障國民健康，行政院將原食品安全推動工作小組，轉型並擴大為行政院食品安全辦公室，將於22日正式成立。
他指出，食品安全辦公室是常設性任務編組，負責督導協調、統籌推動跨部會食品管理工作，下設置管理協調組、應變溝通組、稽查取締組、資訊服務組等業務單位，由行政院政務委員督導，目前暫時由即將接任衛生福利部長的政務委員蔣丙煌督導，並置主任及副主任綜理相關業務。
至於人員編制，孫立群表示，食品安全辦公室將置20名專職人員，成員包括行政院編制內人員、各食品安全業務有關機關（含內政部、財政部、經濟部、衛生福利部、法務部、農委會等）及財團法人借調人員、具專業的約聘人員等，部分人員已於今天起進駐。
孫立群表示，馬總統10月13日第一次主持國安高層食安會議時，指示國安單位全力蒐報食安預警情資及發掘不法案源。
他說，國安局已於10月16日偕同警政署、調查局成立「預警會報」，於2週內先期蒐整食安問題檔案及檢舉資訊，主動提供行政院食安辦公室參考。
孫立群表示，遇有跨轄偵辦情形，將轉食安辦公室協請高檢署派駐的檢察官負責協調偵辦。預警會報也將納入海巡署、移民署及憲指部等機關成員，以利統合發揮國內、國境、境外及海域的黑心食品查緝能量。