台灣糖果餅乾麵食公會總幹事陳朝陽表示，日本厚生省和農林水產省以行政指導方式發函各港口檢疫所，將台灣兩百三十五家涉入強冠劣質豬油事件廠商的全系列產品進行扣留，不允許通關。
以盛香珍品牌聞名的成偉食品，九月十八日結關出口到日本名古屋的兩個貨櫃，並無使用劣質豬油生產產品，至今仍被日本海關扣留，何時能清關？尚無確切時間。該公司名古屋客戶心急如焚電詢厚生省，得到的回應卻是一直未收到台灣方面相關回覆，無法讓貨櫃放行。
以虎牌米粉聞名的正通實業及盛記食品廠，分別出口到日本的虎牌新竹米粉及紅豆沙產品，也遭橫濱海關及川崎檢疫所扣留；因有扣關情況，新的訂單生產後不敢出貨，後續訂單也暫停生產。
陳朝陽指出，雖然衛福部已於九月廿四日從官網移除涉餿水油事件的兩百三十五家廠商，但中國質檢總局至今仍要求涉及誤用餿水油廠商暫停受理其全系列產品通關報驗，且要求上架流通的全系列產品下架回收，出口廠商哀鴻遍野。
衛福部官員表示，目前更換油品的業者、商品資訊均已公佈在食藥署網站上 （http://www.fda.gov.tw/TC/siteList.aspx?sid=4103），提供查詢，外交部、經濟部駐外單位也會向當地國家說明。若業者仍碰到類似情形，可出示政府查核合格文件，或向駐外單位尋求協助。