馬總統在開幕典禮致詞時表示，在南海主權爭議高度敏感之際，這次展覽透過政府檔案史料的首度公布，向各界正式呈現我國早年經營南海諸島的過程，彰顯我國對於南海歷史主權的正當性，意義重大。同時，也重申「主權在我、擱置爭議、和平互惠、共同開發」的基本原則與立場，並期盼將「東海和平倡議」的理念與精神，擴大運用到南海等東海以外地區，以對話取代對抗，以協商擱置爭議，以和平方式解決爭端。
「中華民國南疆史料特展」是由內政部、國史館、中央研究院、外交部、國防部、行政院海岸巡防署、國家發展委員會檔案管理局及國父紀念館所共同籌劃，上午出席開幕典禮的來賓，除了總統馬英九外，總統府資政胡為真、秘書長楊進添、國策顧問陳錫蕃、與內政部、外交部、國防部等部會首長以及各界學術代表共同參與，儀式簡單隆重。
內政部長陳威仁表示，南海諸島及周圍環繞海域是我國人們長期活動的場域，因與臺灣隔著廣闊的藍色海洋，大部分民眾對這塊國土可能不太熟悉，為了讓民眾對南疆國土有進一步的瞭解，內政部在相關部會的協力下，自民國100年起開始整理官方保管的南海檔卷資料，2年多來彙集了上萬件的資料。今年陸續與相關部會及專家學者多次會商後，挑出部分具關鍵性、代表性的史料，希望能具體呈現我國在南海諸島擁有主權的地位。部分照片內容更是由早年巡弋駐守南疆的軍士官所提供，別具重要意義。
內政部指出，這次展出的檔案雖然早已解密公開，但分散在各檔案保管機關，一般民眾不易全面瞭解，所以展出內容分為「南海諸島歷史淵源」、「南海諸島設治」、「南海諸島主權的維護」、「南海諸島經營與管理」及「相關人物事蹟」等5大主題，便於民眾較有系統來觀看。同時，內政部呼籲民眾如果發現自己家中，保存關係我國主權論證的早年南海地區的地圖、書籍或照片等，懇請提供給內政部，讓史料更完整豐富。這次活動臺北展期自9月1日至10月31日止，並將於10月9日、11月17日陸續於高雄、臺中等地展出。民眾可免費入場，歡迎大眾共襄盛舉。