應撤銷、追回升等及補助案
民進黨發言人黃帝穎指出，蔣偉寧在事件爆發第四天請辭部長職務，只是符合政務官最基本的誠信要求。「雖然他辭去部長職務，但司法與行政調查才正要開始」，如果蔣偉寧的這些論文得到政府補助，則涉及觸犯刑法詐欺罪，可處五年以下有期徒刑，如果蔣過去申請升等或相關補助時，曾切結自己是這些造假論文的共同作者，則恐觸犯刑法偽造文書罪，同樣面臨五年以下有期徒刑的罪責。
黃帝穎說，科技部、教育部應立即展開行政調查，如果蔣偉寧等人過去的升等、補助與這些造假論文有關，相關單位應撤銷或追回他們的升等及補助案。
民進黨立委陳亭妃表示，蔣偉寧剛上任時，還有一點學者的風骨，經過立院一會期之後，就只會用硬拗、反質詢，這次事件中，也可看到蔣偉寧一開始硬拗，最後馬政府見紙包不住火才斷尾求生，蔣雖下台，事件仍應調查；國民黨立委陳學聖也說，這件事情還是要透過行政、檢調調查，把真相還原。
至於蔣偉寧任內倉促實施十二年國教所留下的爛攤子，民進黨要求馬、江趕緊檢討改善、收拾殘局，給全國學生及家長交代。
朱敬一轟蔣早該為12年國教下台
朱敬一昨在媒體發表文章批評，蔣偉寧顯然搞不清楚政務官的責任界定；不知情的造假論文，無論如何是個污點，蔣偉寧該負道德操守面的責任。然而即使沒有論文造假案，朱敬一也認為，蔣偉寧早該為十二年國教政策惹得天怒人怨而下台負責。
他在文中質疑，十二年國教推動至今，因為國中升高中會考與選填志願的爭議，使得數十萬考生與家長怨忿不滿，政務官要推十二年國教，一定有一以貫之的理念統整，才能鋪陳策略、研議推動步驟，而非只是「貫徹長官意旨、避免中箭落馬」。
柯文哲：學術界需檢討
無黨籍台北市長參選人柯文哲也說，如果蔣是因十二年國教下台，「我還比較甘願一點」。他另表示，過去論文要找些「大牌」來掛名，但有時掛一掛「炸彈就來了」，學術界需檢討，不要只衝論文數量。