根據台鐵的新時刻表，16日起花東線因實施電氣化全面改點，普悠瑪停靠方式有3種，包括直達、半直達與多站停靠。
台鐵說，這3種模式分別在花東間採跳蛙式停靠，可發揮普悠瑪最大效能。
台鐵表示，花東線因87%路段仍是單線區間，班次會受限制，加上壽豐站目前仍在進行工程施工，場站條件較差，才安排週一至週四，每天停靠2班太魯閣，週五至週日，停靠2班太魯閣與2班普悠瑪列車。
另台鐵也強化花蓮至台東區間車功能，EMU500型空調電聯車取代DR2700普快車，每天由15列次增至21列次，搭配各級對號列車，於花蓮、台東間各站提供旅客轉乘服務，台北至花蓮－台東間，總旅行時間可較現行搭乘柴聯自強號節省約30至100分鐘。
台鐵表示，改點後會密切注意旅客搭乘情形，年底局部微幅調整，並將太魯閣及普悠瑪列車整體運用，增加花東地區列車服務效能。