平面媒體報導，教育部長蔣偉寧日前邀集專家針對12年國教總綱召開閉門會議，由於意見紛歧，最後可能退回重擬。
不過，教育部17日澄清，表示12年國教總綱草案經過3,200多個小時的討論，最後將送課審會定案，目前傳出的消息只是個別委員的意見。課審會預定7月1日召開，屆時才會有最終決議。國教院副院長曾世杰說：『(原音)課審會是好多委員組成的，裡面有些委員是有不一樣的意見、比較強烈的意見，那是OK的，但是應該所有的決議都在課審會大會召開通過之後才算正式決議嘛，現在個別委員的意見好像被解釋成變成教育部的決策，我不曉得她消息怎麼來的，因為連會都沒有召開，課審會大會都還沒召開呢。』
教育部強調，目前各學科分組會議還在審查課綱草案，若委員們有意見，有可能修正，但課審會根本還沒有召開，一切都言之過早。不過，教育部強調，12年國教總綱非做不可，一定會完成，不會夭折。