該局說明，若納稅義務人適用核實課稅，且計算證券交易所得時，係按成交價格減除原始取得成本及必要費用計算者，則出售股票時之交易損失可自證券交易所得中扣除。
該局指出，申報股票交易損失時，應檢附以下文件供稽徵機關查核認定：
（一）經由證券經紀商出售的證券：應檢附買賣報告書、對帳單或其他足資證明買賣價格的文件。
（二）非經由證券經紀商出售的證券：應檢附收、付款紀錄、證券交易稅繳款書、買賣契約書或其他足資證明買賣價格的文件。
另請納稅義務人應特別注意，雖綜合所得稅係以家戶為申報單位，而證券交易所得申報也是以家戶為申報單位，惟納稅義務人與其依所得稅法規定應合併申報的個人（包括本人、配偶或合於規定申報減除扶養親屬免稅額的受扶養親屬）就證券交易所得或損失應分別計算，且個人經計算有證券交易損失者，僅得自其個人當年度證券交易所得中減除。