龍燈生技新化新廠遭質疑將產製農藥相關產品，4月1日動土典禮遭當地上百名居民衝進會場抗議，還和員警、保全人員發生拉扯。居民揚言，抗爭將會繼續，不會讓工廠動工。
台南市長賴清德臉書則被灌爆嗆聲，市府16日、昨天罕見地連發三篇聲明，一篇措詞比一篇強硬，要求龍燈儘速召開記者會對外釋疑，也要寄送更詳細資料給市府，龍燈新廠若是對環境有污染之虞，市府絕不會核准設廠。
市府工務局今天下午則以違反台南市建築管理自治條例及建築法，撤銷龍燈新廠建照。
工務局長吳宗榮說，龍燈生技去年7月12日取得建照，申請主要用途為一般廠庫，不是具有公害的工廠，依規定應於今年4月12日前完成申報開工程序，也就是整地、挖地、打樁或從事安全措施等工程。但市府勘查現場發現，龍燈新廠未有開工實際工作，違反台南市建築管理自治條例。
另外，依建築法規定，龍燈新廠案已違反維護公共安全、公共交通及公共衛生的規定，市府依法撤銷建照。
吳宗榮表示，龍燈新廠為丁種用地，只能申請一般廠庫，龍燈新廠建照被撤銷後，可依法再提出申請。