教育部13日在行政院會報告「高中課綱微調情形」，行政院長江宜樺表示，課綱微調引發社會關注，但新課綱朝配合國際脈動、貼近史實和落實憲法增修條文的精神方向調整，他給予肯定。行政院發言人鄭麗文轉述說：『(原音)微調過程已經蒐集高中教師及學生意見，並邀請曾任或現任課綱審定委員等各領域學者專家參與，歷經公聽會等程序後，在103年1月27日經審議大會出席委員表決過半數通過，程序符合規定，對於教育部還原日本殖民史實，以及強化中華民國憲法和台灣主體性的努力，院長表示高度肯定。』
不過，台南市副市長許和鈞與高雄市副市長李永得，則質疑新版課綱的意識型態引發社會分歧，要求行政院不要背書並暫緩實施；台中市副市長蔡炳坤表示支持新版課綱，但仍希望教育部多和基層教師團體溝通。
對此，教育部長蔣偉寧解釋，課綱檢核小組成員都是學者專家，所謂課綱調整時效問題是外界的誤解，只要有需要，就可以修改課綱。教育部次長林淑真也在行政院會後記者會上指出，教科書依據課綱編寫，選書權在各學校，縣市政府應該依法行政。