賴正鎰指出，12月17日商總會員代表大會選舉及理監事改選，為前任商總理事長張平沼主持，卻藉主席職務之便，做出操縱、誤導選舉的違法行為，還在事後向內政部提異議，指稱自己主辦的選舉無效。
賴正鎰指出，主管人民自治團體業務的內政部，若以數人提出混淆事實的異議文書，做出不利之處分，將傷害商總121個全國商業團體及600多名會員代表的合法權益，如同助紂為虐，這樣將令所有121商總會員的公會代表無法接受，恐會引起上百萬家商家不滿、抗議的聲音，甚至不排除要包圍內政部。
他指出，開會當天內政部的三位官員也都到場列席指導，若對選舉過程有異議，就應當面提出糾正，但卻在投票完成前就提前離席，迴避其應依行政程序法第165條，應為行政指導之義務，即已明確表示其認同理監事選舉之團體自治原則，但內政部此惡例一開，將令所有掌握人民團體選舉之人，可在選舉程序中故意設計安排有利其細節，若選舉有利則不提異議，選舉不利就提異議推翻其選舉結果。
他也強調，商總在改選當天已交接完畢，並依法執行會務工作快兩個月，理監事會議也都正常進行召開並推動各項業務，像商總今年預計在台灣舉辦10場大型展覽，並爭取到大陸舉辦兩岸文創博覽會及相關商業及服務貿易等8場會展及論壇活動，另有國際交流及海外考察等行程，商總仍會按照新年度排定的計畫進行，不受影響。