針對美河市案，媒體今(7)日指出，此案遭法務部發函判定有違憲之虞，台北市捷運局則澄清，上個月3日收到法務部函示，內容指出美河市案徵收土地移轉為私有土地的適法性，法務部尊重相關主管機關認為此案不受土地法限制的解釋，並未提出北市府有違憲的意見；同時，法務部也否認有此說法。
《聯合報》報導指出，法務部發函給交通部及內政部，認為北市府以聯合開發方式徵收美河市土地如須移轉私人(建商)，依照大法官的解釋，應明確授權行政機關訂定法規命令，因此全案有違憲之虞。
對此，捷運局說明，法務部指此案違憲一事有誤，因監察院提出糾正案，目前北市府正重新辦理土地價格及建造成本之鑑價，北市府目前實際產權登記持分之總和(含捷運設施30.27％、捷運獎勵2.55％、公地主16.06%等)為48.88%，未來應可再增加。
針對媒體報導，法務部發言人陳明堂也澄清，由於監察院向交通部提出糾正，交通部發函詢問修法意見，因此法務部在去年10月回覆交通部，表示聯合、合作開發應注意大法官第443號解釋的「授權明確性原則」，但並未指美河市案有違憲之虞。