初審條文規定，任何人若以強暴、脅迫、恐嚇或其他非法方式，滋擾醫療機構秩序或妨礙醫療業務執行、危害醫療安全或其設施，警察機關應協助排除、制止。並可處新台幣3萬元以上、5萬元以下行政罰鍰。
修法將第一線裁量權交給警察，若前述行為涉及刑事責任，應移送檢察官偵辦。
修法也賦予醫療機構責任，醫療機構必須採取必要措施，確保醫事人員執行醫療業務時的安全。
此外，初審條文新增罰則，毀損醫療機構或其他設備，導致危及他人生命、身體或健康者，處3年以下有期徒刑、拘役或30萬元以下罰金。
對醫事人員執行醫療業務時，施強暴、脅迫者，處5年以下有期徒刑、拘役或50萬元以下罰金。致醫事人員於死者，處無期徒刑或7年以上有期徒刑；致重傷者，處3年以上、10年以下有期徒刑。
民主進步黨籍立法委員林淑芬反對初審條文。她表示，新增罰責不夠嚴謹，萬一往後產生醫療糾紛，弱勢者採取特殊手段，例如抬棺抗議，恐會因為「對執行業務的醫事人員施強暴脅迫」遭處5年以下有期徒刑。弱勢者將遭受更大壓迫，修法周延性有問題。
親民黨也對修法表達不滿，親民黨發言人吳崑玉表示，親民黨團去年就提修法，強暴、脅迫、恐嚇或滋擾醫療機構秩序、妨礙醫療業務執行，導致執行醫療業務人員受傷，應移送檢察官偵查後提起公訴，不受刑法287條須告訴乃論的限制。現在的初始條文乍看很好，其實只是跟現行法沒太大差異。
衛生福利部醫事司長李偉強會後受訪表示，過去違反醫療法相關規定、又觸犯刑事責任者，回歸一般刑法規定；修法則在醫療法中另訂罰則，觸犯相關刑事責任者可優先適用。
記者詢問，為什麼不將「公訴」明寫在法條中？李偉強說，畢竟「公訴」只是個口語用詞，修法已達到非告訴乃論罪的實質效果。
民進黨籍立委田秋堇、陳節如則說，為了加強對醫糾事件的病患、家屬保障，應該加快腳步通過醫療糾紛處理法。