千萬元研究經費中止
洪蘭本是國內神經科學權威，國科會卻讓她領導國家型原住民教育計畫，日前先遭台灣大學心理系教授黃光國公開質疑，又遭民進黨立委鄭麗君痛批她是「跨行領導」；且國科會原住民教育研究經費約一．五億，洪蘭的兩件計畫總計約三千三百萬，亦即她一人就佔去了原住民教育研究經費的二成二。
跨領域主持計畫遭非議
該辦公室隨後在官網發表聲明指出，洪蘭多年深耕原住民教育服務工作，以認知神經科學專長為主軸，結合原民文化的特殊性，建構平台以匯集各界力量，共同推動原住民科學教育的工作。相關計畫書都符合公開徵選審核規定，並經匿名審查通過。
但因鄭麗君踢爆洪蘭於第一期計畫尚未結束且未檢討執行成果時，國科會科學教育發展處未獲主委或副主委簽核，便公告徵求第二期相關計畫，且撥給洪蘭一千兩百多萬元。國科會昨天認定行政程序不完備，決議中止該計畫，並將失職人員移送考績會懲處，但原本的第二期上千萬元研究經費，仍將用在推動原住民科學教育。
中央大學昨晚發布聲明稿，表示洪蘭出國，謝謝各界關心她主持的原住民科學教育計畫案。中央大學對於國科會計畫的審查機制都採取配合的立場，並給予尊重，洪蘭主持通過國科會審查的各項學術研究發展計畫，也都給予支持。
洪蘭近來風波不斷，有學者比對她翻譯的《快思慢想》等多本原著後，認為洪蘭譯作為「不要臉的劣譯」。洪蘭則只聲明表示，譯作不盡理想之處，有人指正，當然虛心接受，讓自己再進步。